这是1891年和一名军医，中尉克劳德德罗斯（克劳迪奥凯西奈莉）一个没有一个幸存者，但两个沉船冲刷上岸，在一个神秘的，未知的加勒比海岛随着一小撮罪犯。当这几个犯人遇到不幸结束在名义上的渔民手中，克劳德和其他的幸存者逃进了丛林，只有遇到残暴的爱德蒙Rackham（李察约翰逊）和他美丽的俘虏，阿曼达马尔文（巴巴拉巴赫）。
阿曼达的父亲，厄内斯特教授马尔文（约瑟夫科顿），一次着名的生物学家，已经发现一种方式转变人类的两栖动物和控制他们的一举一动。马尔文Rackham操纵进入执行程序后，愿意与不愿意的人向他保证，他的工作是纯粹的科学和人道主义的动机进行（马尔文希望通过创造一个种族的人可以生活在资源尚未开发的海洋减少对世界粮食供应紧张）。发现失落的亚特兰蒂斯岛周围的水域下但是，Rackham是在现实中使用的半人的怪物掠夺的财宝失落的城市。
夏奇拉（坎宁安Rackham绿柱石），在使用巫毒祭司预示着死亡和毁灭降临岛。
女祭司预言是影片的结尾，克劳德和阿曼达试图逃离持枪海盗了，疯狂的夏奇拉，不受控制的渔民，注定了亚特兰蒂斯唤醒并威胁要送什么不淹没的陆地火山仍然被遗忘。
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