《神笔马良》讲述了热爱画画又调皮捣蛋的小马良，生活在一个叫百花村的村庄。有一天这里平静的生活被一阵隆隆的炮声打破，一个贪婪又凶残的大将军，挟持着小皇帝来到了百花村，企图将村里老百姓赶走，挖掘地下的金矿。泼墨仙人察觉到百花村会有一场劫难，为此特地下凡人间，把一支神笔托付给了马良，希望马良能用神笔拯救百花村……
在很多人的记忆中，小马良应该是个眉清目秀的瘦子，不过这次迪士尼画风下的小马良，不仅变成了“神笔侠”，而且还成了一个萌蠢萌蠢的小胖子，甚至有点萌萌哒的感觉。对此导演钟智行透露，其实最初也画过一些大眼睛的、瘦瘦的、很标准的英雄式的人物，但这样的人物太冷冰冰。
在小马良的性格塑造上，导演不希望把他描述成一个完美的人，一个英雄式的人物，而是选择贴合当今普通小孩的模样，有一点点胖，但也没那么胖，这样的主角会更打入小孩的心，因为他像他，或像身边的朋友一样。小马良的造型设计，据透露前前后后有50多稿，尝试了不同年龄、不同身高，不同身材比例，包括头发数量，质量硬一点，或软一点的效果，衣服的款式设计，甚至脸上的小雀斑数量也是经过多次测试。
造型方面，关键道具神笔听取了多方建议，共设计了约100多款。主角马良的造型设计了50多稿，尝试了不同年龄、不同身高，不同身材比例，包括头发数量，质感硬一点，或软一点的效果，衣服的款式设计，甚至脸上的小雀斑的数量也经过多次测试。初期测试人物效果图、三视图约450张，北京效果图约300张，多方案进行灯光测试、特效测试。而影片的每个环节，都有华特迪士尼中国的全球顶尖专业人员，针对剧情、设计、动画、灯光、特性等等，进行指导和修改，以求让每个环节的质量都达到最优，所以整个影片的品质在不断提升中，充满了浓郁的迪士尼风格。
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