1.钢铁侠为什么会找上蜘蛛侠?
编剧克里斯多夫马克斯表示，这与《复仇者联盟：奥创纪元》的故事有关，因为东尼史塔克从《钢铁侠3》时，就拥有监测各地犯罪状况的设备，他能看到犯罪案件，也能发现从未出现的超级英雄，为了暗中监视每个人，所以希望製造奥创，拥有更强大的人工智能来协助这个工作，而蜘蛛侠就是他监测下所发现的年轻人。但是奥创失败后，钢铁侠有点自信受挫，即使创造了幻视，他需要找到更多的帮手，这也是为何他要找蜘蛛侠的原因。
导演乔罗素更表示，在漫威宇宙中，蜘蛛侠是资历最浅的超级英雄，需要有人来带领他，而带领他的导师就是钢铁侠，而他与钢铁侠是互补的。托尼史塔克因为小辣椒离开他后，失去了生命的重心，他需要调教蜘蛛侠，为他自己的生活产生正能量。
电影中的彩蛋，预告了蜘蛛侠的独立电影《Spider-Man： Homecoming》，未来也可以预知小罗伯特唐尼的钢铁侠在剧中的戏份将有更多教导蜘蛛侠的互动。
2.黑寡妇到哪去了?
黑寡妇在剧中，放走了美国队长及冬兵巴奇，成了钢铁侠嘲讽的「双面间谍」，随后就消失，行踪成迷。黑寡妇的角色在斯嘉丽约翰逊的诠释下，散发着一种猜不透的神祕。她在2010年《钢铁侠2》就登场，之后2012年《复仇者联盟》、2014年《美国队长2》、2015年《复仇者联盟2》、2016年《美国队长3：英雄内战》均有在剧中，她和几位复仇者联盟的男性成员，包括钢铁侠、鹰眼、美国队长、浩克都有一些暧昧。(请参考阅读：超级英雄的「叁角恋」习题?队长情归何处?)
在这次《美国队长3：英雄内战》中，有一幕失控的冬兵巴奇，掐住她的脖子，然后黑寡妇居然挣扎的回问巴奇，「你应该还记得我吧?」这句话代表什么意思?原来暗示着，黑寡妇的一些过去。
在《美国队长2：冬兵》中，黑寡妇就曾向美国队长表示自己过去曾与冬兵交手过。在原版漫画中，冬兵与黑寡妇两人确实有不少渊源，他们都曾在苏联受过训练，黑寡妇有部分的训练，还是由巴奇所指导，后来两人日久生情，成了一对恋人。
外传黑寡妇一角一直要拍成独立电影，漫威影业总裁凯文费奇已答应影迷的期待，他表示，「黑寡妇是一个很迷人的角色，斯嘉丽约翰逊所塑造出的形象相当优秀，如果能将黑寡妇拍成独立电影，应该会非常有趣。」
未来黑寡妇的剧情发展，有许多条线都可以进行，包括她的特务生活、双面间谍的工作，穿插在超级英雄间的感情戏，甚至与冬兵巴奇的过去。有趣的是，黑寡妇在漫画的年龄设定，只比美国队长小11岁。不过虽然「黑寡妇」真要拍成独立电影，可有得等了，依漫威电影排程的规画，可能最快要到2020年，还要等4年，会不会有点久了。
3.幻视的未来会走上奥创的路吗?
幻视一角在漫画中是反派奥创所创造的，电影则是出现在《复仇者联盟2》裡，他原是钢铁侠的管家贾维斯，他的身体是奥创用「再生摇篮」製造，并由汎合金为材料，生命的来源是源自权杖上的心灵宝石，最后再加上绿巨人浩克和钢铁侠上传贾维斯的意识所完成，他和奥创一样都是属于人工智慧合成的机器人，只是幻视的等级更高，有更好的意识。
但在《美国队长3》中，他和绯红女巫的关係有些暧昧复杂，情感也有了转变。虽然幻视和绯红女巫在电影中看起来不太登对，但在漫画的设定中，他们两人是夫妻。绯红女巫」由伊莉莎白欧森饰演，在《复仇者联盟 2：奥创纪元》中登场后，人气显然不亚于黑寡妇。
「绯红女巫」原名汪达马克希莫夫，是快银的双胞胎姐姐，快银在《复仇者联盟 2：奥创纪元》中已被赐死。在漫画原着中，她被万磁王视为女儿，在电影《复仇者联盟 2：奥创纪元》改编角色设定，成了九头蛇基因实验产生的基因改造人，而非原本漫画的变种人。「绯红女巫」拥有强大的超能力，后来成了幻视的妻子。
幻视与绯红女巫在漫画中有不少情感的纠葛，当他有了一些复杂的情感后，思考也有了变化，他逐渐失去判断，并且一直追寻自己与奥创的相关起源，企图以极权主义统治世界。或许未来漫威电影，幻视还不会走向这一步，但《美国队长3》中，已看出他误射战争机器，他的精准因为绯红女巫的情感影响而有了误差。
4.神盾局局长尼克福瑞到哪去了?
山缪杰克森饰演的神盾局局长尼克福瑞，几乎是每集漫威电影必定会出现的人物，尤其电影最后的彩蛋，连死侍都要亏一下，山缪杰克森一定要现身，观众才能离开。可是这集从头到尾都没有他的角色，在漫威的漫画裡，尼克福瑞没有超能力，却是可以与超级英雄自在沟通，地位也极为重要 。
此次没有参加英雄内战，《美国队长3》编剧克里斯多福马克斯、史蒂芬麦菲利表示，这集未出现尼克福瑞的角色，主要是不想让观众陷入，他是政府的人的思考，毕竟在剧中已有不少政治性的角色。
那尼克福瑞还会出现吗?依山缪杰克森与漫威还有两部片约，《复仇者联盟：无限之战》(Avengers: Infinity War)两集，他应该会现身。
5.还有两位原本要现身的超级英雄未现身?
除了雷神索尔和绿巨人浩克外，编剧表示原本设定第一代蚁人皮姆汉克及其女儿黄蜂女都会连同蚁人现身，因为这样更可延续解释蚁人与钢铁侠家族的恩怨不合，制造合理宣战选边的理由，只是最后并未将两位角色纳入剧情。
最主要原因是找不到对的时间让两人出现，同时也担心如果出现，可能也无助影迷理解剧情，因为这次登场的人物实在不少，只是未来这问题还是会在《复仇者联盟3》出现，因为角色太多，各路英雄的戏份铁定减少。
《蚁人》的彩蛋中，已知道「黄蜂女」即将现身，艾文洁琳莉莉( Evangeline Lilly)饰演黄蜂女一角也吸引不少影迷注意，只是最快要等到2018年《蚁人2》，她才会现身。
